北京大学口腔医学院始建于1941年，是集北京大学口腔医学院、口腔医院和口腔医学研究所为一体的医疗机构，长期以来承担着向社会提供口腔医疗保健服务和口腔教学、医学研究的重任。拥有诸多国内外著名的口腔医学专家，为我国口腔界培养了一批批高素质、高层次专业人才，成为我国重要的口腔医学研究基地之一，是我国口腔医学对外交流的重要窗口。

作为卫生部部管的三级甲等口腔专科医院，是目前国外上口腔专科医疗服务规模较大的医疗机构。现有临床科室15个，医技科室8个，下属分支医疗机构5个，牙科综合治疗台510台，开放病床157张，职工2000余人。2012年门急诊量超过117万人次，日均门急诊近4000人次，年收治住院病人5000余人。还承担着党和国家领导人及其他重要人员的口腔医疗保健工作。在长期学科建设和临床实践的基础上，已逐步凝练、形成了独具特色的口腔医学临床学科群。目前有四项口腔类别“国家临床重点专科”建设项目：牙体牙髓病科、牙周病科、口腔颌面外科、口腔修复科。自2009年起，连续三年被评为“中国较佳医院及较佳专科排行榜”口腔专科第一名。

作为我国高层次口腔医学专业人才的培养基地，现有专业教研组（室）21个，博士生导师44人，硕士生导师49人，拥有国家“千人计划”特聘专家、“长江学者”讲座教授、杰出青年基金获得者等著名专家，聘请境外数十名知名学者任院级客座教授。是首批一级学科硕士、博士点授权单位，同时也是目前全国优秀由教育部批准招收口腔医学八年制本博连读生的口腔医学院校，目前在校生总数700余人。在15部口腔医学全国统编教材中7部教材的主编由北京大学口腔医院教授担任。中国第一位医学博士（1984年）、第一批口腔临床技能型博士（1988年）、第一位口腔医学双博士（2012年）均由该院培养。几十年来，北京大学口腔医学院培养出一代代优秀的学子，推动了中国口腔医学事业的发展，也涌现出一批在国外口腔医学领域颇具成果的著名学者和专家。

北京大学口腔医学研究所成立于1978年，目前设有中心实验室1个、临床和基础研究实验室13个、以口腔常见疾病防治为主导的跨学科研究中心11个、实验动物室1个和1所口腔医学专业图书馆。医学领域第一家“口腔数字化医疗技术和材料国家工程实验室”、全国优秀“国家口腔医学国外科技合作基地”、“卫生部口腔医学计算机应用工程技术研究中心”和作为国内十大专业级医疗器械质量监督检验中心之一的“口腔医疗器械检验中心”均设在此院。

作为国内口腔医学院校的领军单位之一，北京大学口腔医学院一直是中华口腔医学会的支撑单位和会长单位，也一直是《中华口腔医学杂志》的总编单位。在中华口腔医学会的24个专业委员会中，8个专委会的主任委员和3个专委会的候任主任委员由此院教授担任。受卫生部、中国医院协会等部门委托，制定口腔领域多项标准、规范《口腔专科医院评审标准》、口腔专业临床路径标准等。