温州市中医院创建于1923年，医院前身是由工商界开明人士蔡冠夫、陈子明、陶履臣等人筹款创办的“专以施医施药救济贫病者为宗旨”的医疗慈善机构——永嘉募办普安施医施药局。 经过近百年的发展，医院现系国家三级甲等中医医院，全国“文明单位”、省级“平安医院”、“绿色医院”，承担浙南地区中医医疗、教学、科研、培训、养生、保健等任务，具有较高的学术水平和良好的社会声誉。

医院现有职工1600余人，总占地面积112.7亩，建筑面积13.4万平方米，拥有六虹桥、景山、水心、龙湾等院区，总开放床位超过1400张。2015年11月，组建成立温州市中医医疗集团，其中下属紧密型专科医院：文成县中医院、洞头区中医院；2018年3月，全面托管泰顺县中医院。

2021年3月温州市中医院城市医联体成立，医联体单位包括：鹿城区水心社区卫生服务中心、鹿城区南浦社区卫生服务中心、鹿城区南郊社区卫生服务中心、瓯海区中西医结合医院、瓯海区人民医院等5家单位。温州市中医院为总院，医联体单位增挂“温州市中医院城市医联体分院”牌子，分别命名为松台水心分院、南浦分院、南郊分院、新桥分院、将军分院。城市医联体实行优质医疗资源下沉帮扶，基层医疗人员向上学习的上下联动模式，基层诊疗量明显提升，医疗资源利用效率和整体效益大幅度提高，实现了基层首诊、双向转诊、急慢分治、职责清晰、功能健全的富有中医特色的诊疗体系。