浙江大学校医院是学校直属单位，和浙江大学校园卫生与健康办公室合署办公，增挂“浙大二院校医院院区”，由浙大二院按院区模式全面托管。校医院是集医疗、科研、预防为一体的、按三级甲等医院管理的综合性医院，是全国高校保健医学学会副理事长单位，浙江省高校保健医学学会理事长单位。是省、市医保定点医疗单位，实施24小时对外开放服务。

校医院设有玉泉、紫金港、西溪、华家池、舟山、海宁、之江、求是、紫金文苑九个医疗点，现有职工358名，其中卫技人员290人，具有高级职称的医务人员58名，有床位180张。开设急诊科、普内科、心血管内科、消化内科、呼吸内科、神经内科、感染科、心理科、儿科、普外科、妇科、骨科、肛肠科、皮肤科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、中医科、理疗科、心理治疗中心、内镜中心等临床医疗科室，以及药剂科、检验科、放射科、特检科（包括B超室、脑电图、心电图室）等4个医技科室。拥有GE和西门子16排CT各1台、全数字化双版DR共7台、西门子和GE彩超共8台、日立7180全自动生化分析仪、西门子免疫荧光检测仪、5分类贝克曼血球计数仪、数字化口腔全景机、奥林巴斯电子胃镜、电子肠镜和腹腔镜、关节镜、动态心电图和血压仪、便携式彩超以及流动DR体检车等专业的医疗设备，可满足广大师生员工与周边群众日常的医疗保健需求。  医院每年接待门诊病人60余万人次，每天均有浙大二院专家来院进行专家门诊、专家查房和手术指导，能开展诸如胸腔镜、腹腔镜、关节镜微创手术，胆囊摘除术、甲状腺次全切、胃肿瘤切除、骨折内固定等各类手术。   医院坚持“患者与服务对象至上”的核心价值观，以优质的服务、优良的环境、合理的收费，不断提高办院水平，更好地服务师生员工和中国特色世界一流大学建设。