昌吉州人民医院眼科成立于1979年，1985年和北京同仁医院合作，由同仁医院眼科专家在科室协作指导工作，科室分期分批派人去同仁医院眼科进修学习。1990年被自治区卫生厅三康办定为新疆首批白内障复明定点医院。1992年和上海医科大学进行技术协作，积极引进开发新技术，1995年被批准为昌吉州眼病防治中心。昌吉州人民医院本着“世界在您的眼中，您的眼睛在我的心中”的服务理念，全心全意为患者服务。

昌吉州人民医院眼科年门诊量18000人次，住院部设病床30张，有医护人员19名，主任医师2名、副主任医师3名、主治医师1名，副主任验光技师1名，副主任护师2名、主管护师4名，护师3名，形成了一支技术力量较强的业务骨干队伍。

昌吉州人民医院眼科开展各类白内障手术，各类青光眼手术、视网膜脱离手术、眼底病激光治疗、泪道激光手术、各种眼外伤、近视手术、斜视矫正、上睑下垂、双重睑及各种眼部整形手术及眼显微外科手术，85％的技术达三甲医院水平，曾获国家专利一项，在国内多家核心期刊发表论文多篇，在同级医院中享有较高声誉。

昌吉州人民医院眼科现拥有进口超声乳化仪，全疆优秀的青光眼早期诊断仪，博士伦超声乳化仪、日本TOPON眼底照相仪及半导体激光、YAG激光、泪道激光治疗仪及眼电生理仪、德国海德堡视网膜断层扫描仪（HRT）、超声角膜测厚仪、眼科A超、全自动电脑视野仪、同视机等多种专业的医疗设备，全方位满足患者的需要。

昌吉州人民医院皮肤科自成立20多年以来，在科室全体医护人员的共同努力下，已由较初的只有门诊发展到今天、门诊与病房融一体的独立科室。

昌吉州人民医院皮肤科目前有医师5名，其中，副主任医师1名，主治医师2名；住院医师2名。护理人员8名，其中主管护理师3名，护理师2名，护士3名。

昌吉州人民医院皮肤科主要由门诊和病房两部分组成。门诊皮肤科对皮肤病患者进行初步的诊断及治疗。对皮肤科常见病如：荨麻疹、湿疹、接触性皮炎、带状疱疹、药疹、过敏性紫癜、多形性日光疹、疥疮、手足癣、神经性皮炎、变应性血管炎、血管瘤、痤疮、各种疣等疾病；以及对疑难顽固性皮肤病如：银屑病、白癜风、盘状红斑狼疮、天疱疮等疾病采取内服与外用等多种手段综合治疗，缩短了病程，增加了治愈率。

昌吉州人民医院皮肤科开展冷冻治疗、激光与微波治疗、腋臭治疗、药浴等一系列特色治疗，皮肤外科还开展对皮肤纤维瘤、色素痣、早期皮肤肿瘤等通过手术切除，既可以达到彻底治疗的目的又可以做组织活检明确诊断。

昌吉州人民医院皮肤科配备窄谱中波紫外线（NB-UVB）治疗仪、摩拉-生物共振过敏原检测治疗仪、伍德氏灯（wood）等设备。