眼科为自治区白内障复明手术、低视力康复定点医疗单位，集医、教、研为一体的综合性科室。现拥有专业技术人员20余名，主任医师、眼科学教授、副教授2名，硕士研究生2名，主治医师3名。从美国引进当今世界较专业的白内障超声乳化仪，已为近3000余名白内障患者实施了复明手术，此项技术已达国际专业水平。拥有当今世界较专业的固体多波长激光，与日本产的眼底荧光血管造影仪形成一对姊妹机，已为众多眼底病、糖尿病、高血压性视网膜病变患者提供了较确切、较直观的诊断依据和较有效的治疗措施。引进的日本产非接触眼压计已为众多青光眼患者提供了较卫生、较快捷的检查诊断依据。拥有日本产全自动验光设备、角膜曲率、眼用AB超、全自动视野计及眼电生理仪等专业设备，能为各类眼病患者提供较专业、较优质的医疗服务。眼科擅长各类复杂眼病的诊断和手术治疗，如难治性青光眼、眼外伤、泪器病、眼表疾病及斜视矫治等。近年来全科先后发表论文40余篇，参编专著二部，获兵团科技进步奖1项。

眼科始终秉承“患者至上，一切以病人为中心”的服务理念。近年来配合兵团残联，坚持每年下基层开展“白内障复明扶贫工程”，积极参与国家民政部开展的“明天计划”等公益性义诊义治活动，先后荣获兵团“扶残助残专业集体”、兵团“残疾孤儿康复手术明天计划专业集体”、兵团“三八红旗集体”等光荣称号。