南京医科大学附属南京第一医院口腔科成立于1986年，于2002年开设病房，并在南院、东院开设门诊。现有20张牙椅，病房床位5张，医护人员20人，其中正高2人，副高4人，主治医师7人，其中硕士研究生8人，主管护技师2人。

年门诊量达40余万人次，其规模在全市综合医院口腔科中名列前茅。口腔科近年来在医、教、研方面都取得了不错的成绩。门诊常规开展补牙、拔牙、缺损牙修复、错颌牙正畸等。其中在被称为“人类第三付牙”的种植牙方面取得了突破性的成果，定期请台湾资深专家进行技术指导，手术质量得到台湾同行的一致好评。另外，牙齿美白也成为该科的特色服务项目之一。

门诊治疗严格遵守各项操作规程，坚持“一人一机一灭菌”的消毒制度。科大学附属医院，该科现在承担七年制临床的教学任务和五年制口腔的带教工作，立志为社会多培养优秀的医学人才。在完成繁忙的临床任务的同时，还承担着5项省、市级课题的研究工作。

医院作为南京医科大学第三临床医学院，教学体系完整，设有临床学位分委员会1个，教学督导室1个、教研室20个；现有博士点14个、硕士点30个；博士生导师20人、硕士生导师153人；教授（含兼职）38人、副教授（含兼职）127人。现有含住院医师规范化培训基地在内的专业级培训基地6个、省级培训基地5个。每年在院培养含博士生、硕士生、本科生、进修生、住院医师规范化培训等各类学员1200人。

医院医疗设备专业，拥有百万元以上设备132套，包括：112环数字光导PET-CT、同位素单光子发射计算机断层扫描仪(ECT)、心血管造影系统(DSA)、专业的双源CT、多层面螺旋CT、1.5T和3.0T磁共振断层扫描仪、直线加速器系统、数字化X线成像系统(DR)、高能超声聚焦治疗机、光学干涉断层成像系统和数字化手术室系统等专业设备。